Bioinformatyka 6.15.BTI-BI
Poznanie podstawowych zagadnień z dziedziny bioinformatyki oraz wiązanych z nimi baz danych. Zrozumienie idei algorytmów i metod komputerowych stosowanych w analizach sekwencji nukleotydowych. Identyfikowanie sekwencji kodujących białko i analizy sekwencji RNA; poznanie podstaw transkryptomiki. Poznanie algorytmów i metod komputerowej analizy sekwencji białkowych. Zastosowanie biblioteki BioPython w analizie sekwencji genetycznych.
Literatura uzupełniająca
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
EUW1 Wie, na czym polegają analizy genomowe i mikromacierzowe oraz przewidywanie struktur cząsteczek
EUW2 Rozumie teoretyczne i praktyczne podstawy analiz bioinformatycznych na różnychpoziomach organizacji informacji biologicznej: DNA, RNA i białek oraz genomów.
EUW3 Student zna podstawowe i specjalistyczne bazy danych dotyczące genów, białek i genomów.
Umiejętności
EUU1 Potrafi zaplanować analizy bioinformatyczne i dobrać odpowiednie programy do postawionego problemu.
EUU2 Student potrafi korzystać z biologicznych baz danych oraz obsługiwać podstawowe ispecjalistyczne programy i narzędzia bioinformatyczne analizujące sekwencje DNA,x`x RNA, białek, poszukujące sekwencji podobnych, wykonujące przyrównania sekwencji, przewidujące
struktury i wykonujące analizy genomowe.
EUU3 Student właściwie interpretuje uzyskane wyniki tych analiz.
Kompetencje społeczne (postawy)
EUK1 Student jest chętny do poszerzania swojej wiedzy przez poszukiwanie dodatkowych narzędzi bioinformatycznych w internecie oraz jest świadomy potrzeby ciągłego aktualizowania wiedzy w szybko rozwijającej się dziedzinie bioinformatyki.
EUK2 Student potrafi pracować w grupie przyjmując w niej różne role
Kryteria oceniania
ustna odpowiedź na pytania
Praktyki zawodowe
nie przewidziano
Literatura
• P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, 2008.
• J.-M. Claverie, C. Notredame. Bioinformatics For Dummies. Wiley Publishing, Inc. 2006.
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: