Inżynieria genetyczna 6.15.BTM-IG
Forma zajęć wykład
W01 Charakterystyka enzymów używanych w inżynierii genetycznej. Enzymy restrykcyjne.
W02 Mikromacierze DNA. Uszkodzenie (nokautowanie) genu. Interferencja RNA.
W03 Schemat klonowania i izolacja rekombinowanego klonu. Podstawowe wektory klonujące, pBR322, fag λ , fag M13.
W04 Transgeniczne zwierzęta i rośliny (metody modyfikacji genetycznej w celu pozyskania terapeutyków)
W05 Budowa, konstrukcja i izolacja rekombinowanych wektorów.
W06 Wektory ekspresyjne, budowa i regulacja ekspresji genu.
W07 Mutageneza ukierunkowana.
W08 Detekcja i analiza sklonowanych genów i ich produktów, hybrydyzacja kwasów nukleinowych (Nothern, Southern blotting), immunodetekcja białek (Westen blotting), elektroforeza w żelach, spektrometria mas. Zielone białko fluoryzujące jako znacznik ekspresji genu.
Forma zajęć laboratorium
L01 Izolacja plazmidowego i genomowego DNA z komórek bakteryjnych i roślinnych.
L02 Trawienie plazmidowego DNA enzymami restrykcyjnymi i analiza DNA w żelu agarozowym.
L03 Transformacja bakterii plazmidowym DNA. Indukcja ekspresji genów w bakteriach rekombinowanych. Izolacja produktu ekspresji genu. Oczyszczanie białka rekombinowanego metodą chromatografii powinowactwa. Analiza poszczególnych etapów uzyskiwania białka rekombinowanego poprzez rozdział w żelu poliakrylamidowym.
Koordynatorzy przedmiotu
W cyklu 2022/23-L: | W cyklu 2022/23-Z: | W cyklu 2023/24-L: |
Efekty kształcenia
Nr efektu Efekty kształcenia
Wiedza
EKW1 Student omawia enzymy stosowane w inżynierii genetycznej, w szczególności enzymy restrykcyjne
EKW2 Student wie, co to są mikromacierze DNA i jakie mają zastosowanie medyczne. Definiuje pojęcia: interferencja RNA, nokautowanie genu.
EKW3 Student wymienia etapy klonowania i metody identyfikacji klonów rekombinantów. Omawia podstawowe wektory do klonowania: pBR322, fag λ , fag M13
EKW4 Student podaje przykłady transgenicznych zwierząt i roślin i ich zastosowanie w produkcji leków
EKW5 Student omawia budowę i metody izolacji rekombinowanych wektorów
EKW6 Student zna budowę wektorów ekspresyjnych i mechanizmy regulacji ekspresji genów
EKW7 Student omawia mutagenezę ukierunkowaną
EKW8 Student wymienia i charakteryzuje metody detekcji i analizy sklonowanych genów i ich produktów
Umiejętności
EKU1 Student potrafi wyizolować plazmidowe i genomowe DNA z komórek prokariotycznych i eukariotycznych, wykonać trawienie restrykcyjne oraz elektroforezę w żelu agarozowym
EKU2 Student potrafi ukompetentnić komórki bakteryjne, przeprowadzić transformację komórek plazmidowym DNA oraz wyizolować klony rekombinantów
EKU3 Student potrafi wyizolować i oczyścić białko rekombinowane metodą chromatografii powinowactwa oraz monitorować poszczególne etapy uzyskiwania białka metodą SDS-PAGE
EKU4 Student potrafi zaplanować eksperyment wymiany kluczowego aminokwasu we wskazanym białku używając metod biologii molekularnej
Kompetencje społeczne (postawy)
EKK1 potrafi współpracować w grupie
Kryteria oceniania
wykład Egzamin pisemny do zdania egzaminu konieczne jest udzielenie poprawnych odpowiedzi na co najmniej 50% zagadnień poruszonych w pytaniach
laboratorium Zaliczenie z oceną ustalenie oceny końcowej na podstawie ocen cząstkowych ze sprawdzianów ze znajomości podstaw teoretycznych dotyczących doświadczeń (70%), poprawności wykonania doświadczeń oraz aktywności na zajęciach (30%)
Literatura
podstawowa
1 Berg M.J., Tymoczko J.L., Stryer L. Biochemia, PWN, Warszawa 2013
2 Buchowicz J. Biotechnologia molekularna, PWN, 2009
3 Bates AD., McLennan AG., Turner PC., White MRH., Biologia Molekularna, Krótkie wykłady, PWN, 2016
4 Nowak Z., Gruszczyńska J., Wybrane techniki i metody analizy DNA, SGGW, 2007
5 Turner P.C., McLennan A.G., Bates A.D., Biologia molekularna. Krótkie wykłady, M.R.H. White; PWN 2007
6 Baj J., Markiewicz Z., Biologia molekularna bakterii, PWN 2006
1 Sambrook J., Russel D.; Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory 2001
2 Rastogi S., Pathlak N.: Genetic engineering, Oxford University Press 2011
3 Howe C.: Gene cloning and manipulation, Cambridge University Press 2007
4 Publikacje polecane przez wykładowcę, pochodzące z Postępów Biochemii, Postępów Biologii Komórki, Postępów Mikrobiologii, Kosmosu
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: